Hormonaalsed häired võivad esineda polüglandulaarse defitsiidisündroomi korral ja neil on tavaliselt geneetiline pärand. See on puudus, kui endokriinsete näärmetega toodetakse hormoonide hulk väiksem kui neil peaks olema.
Selle sündroomi puhul levivad need hormonaalsed häired autoimmuunhaiguse, infektsiooni, verevarustuse ebapiisavaks või isegi kasvajaks.
Tavaliselt, kui näär on kahjustatud, muudavad või lõpetavad selle toimimine. Seda nimetatakse mitmeteks endokriinigade riketeks. Õige diagnoosi teostamiseks võib hormoonide tootmise kontrollimiseks kasutada vereanalüüse.
Seda tüüpi häire ravi põhineb hormonaalsel asendamisel, kuna sellel pole ravi. Kilpnäärme hüpoaktiivsuse korral on ravi kilpnäärme hormoonide täiendamine; kui näiteks on neerupealiste hüpoaktiivsusega indiviid, siis ravi on kortikosteroididega; diabeet ravitakse insuliini ja nii edasi.